🌲 Boreal Bird Ecology & Conservation
🌲 Écologie et conservation des oiseaux boréaux

Hi! I'm Megan.

I'm a PhD student at the University of Alberta studying boreal waterbirds — how we detect them, how they respond to landscape change, and how that knowledge can guide large-scale conservation in Canada's boreal forest.

My work bridges bioacoustics, camera trapping, traditional point counts, and statistical modeling to understand what our monitoring methods actually capture — and what they miss.

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Bonjour! Je suis Megan.

Je suis doctorante à l'Université de l'Alberta, spécialisée dans les oiseaux aquatiques boréaux — comment les détecter, comment ils répondent aux changements du paysage, et comment ces connaissances peuvent orienter la conservation à grande échelle dans la forêt boréale du Canada.

Mon travail combine bioacoustique, pièges photographiques, inventaires par points d'écoute et modélisation statistique pour mieux comprendre ce que nos méthodes de suivi capturent — et ce qu'elles ratent.

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Research

Recherche

The boreal forest holds roughly a third of the world's breeding birds, yet monitoring programs for waterbirds — waterfowl and shorebirds — lag far behind those for songbirds. My PhD asks a fundamental question: how well do our monitoring methods actually detect the birds we care about, and does that vary across habitats and species?

I am working to compare detection probability across autonomous recording units (ARUs), camera traps, and traditional point counts, to learn about how we can use passive monitoring to track waterfowl and shorebirds. Closing this gap matters for conservation planning across the boreal-prairie ecotone.

La forêt boréale abrite environ un tiers des oiseaux nicheurs du monde, mais les programmes de suivi pour les oiseaux aquatiques — sauvagine et limicoles — sont bien moins développés que ceux pour les passereaux. Ma thèse pose une question fondamentale : dans quelle mesure nos méthodes de suivi détectent-elles réellement les oiseaux qui nous importent, et cela varie-t-il selon les habitats et les espèces?

Je cherche à comparer la probabilité de détection entre les unités d'enregistrement acoustique (ARU), les pièges photographiques et les inventaires par points d'écoute traditionnels, afin de mieux comprendre comment le suivi passif peut servir à surveiller la sauvagine et les limicoles. Combler cet écart est essentiel pour la planification de la conservation à l'écotone boréal-prairie.

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Acoustic Monitoring

Suivi acoustique

ARU-based detection probability estimation, HawkEars CNN recognizer calibration, and acoustic localization pipelines for multi-species boreal bird datasets.

Estimation de la probabilité de détection par ARU, calibration du recognizer CNN HawkEars, et pipelines de localisation acoustique pour des jeux de données multi-espèces.

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Waterbird Monitoring

Suivi des oiseaux aquatiques

Bridging the gap between established songbird monitoring infrastructure (BAM, BBMP, ABMI) and boreal waterfowl and shorebird programs (WBPHS, PRISM).

Combler l'écart entre l'infrastructure de suivi des passereaux (BAM, BBMP, ABMI) et les programmes pour sauvagine et limicoles boréaux (WBPHS, PRISM).

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Spatial Modeling

Modélisation spatiale

Species distribution and density modeling using BAM v5 rasters, occupancy models, RSPFs, and QPAD-corrected GLMs across boreal Bird Conservation Regions.

Modélisation de la distribution et densité d'espèces avec les rasters BAM v5, modèles d'occupation, RSPF, et GLMs corrigés par QPAD à l'échelle boréale.

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Wildfire & Climate

Feux de forêt et climat

Investigating how wildfire exposure and climate change shape boreal bird community composition, range shifts, and conservation prioritization.

Étude de l'effet des feux de forêt et du changement climatique sur la composition des communautés d'oiseaux boréaux, les déplacements d'aires et la priorisation de la conservation.

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Wetland Health

Santé des milieux humides

Using waterbirds as bioindicators of wetland health across the boreal-prairie ecotone, integrating point count and ARU data for landscape-scale inference.

Utilisation des oiseaux aquatiques comme bioindicateurs de la santé des milieux humides, en intégrant données d'inventaire et ARU pour des inférences à grande échelle.

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Aquatic Invasions

Invasions aquatiques

Prior work using stable isotope analysis to understand how invasive species (Chinese mystery snail, northern crayfish) restructure reservoir food webs.

Travaux antérieurs utilisant l'analyse des isotopes stables pour comprendre comment les espèces envahissantes restructurent les réseaux trophiques des réservoirs.

Methods & Tools

Méthodes et outils

QPAD offsets N-mixture models Occupancy models RSPF Acoustic localization CNN recognizer calibration R / R Shiny Python WildTrax HawkEars GIS / spatial R BAM v5 rasters OpenSoundscape DHARMa diagnostics ARUs Camera traps Point counts Stable isotope analysis

Current Projects

Projets actuels

My PhD has two sides: some chapters ask how we monitor boreal waterbirds — developing and comparing methods, correcting for detection bias. Others ask what's actually happening to the birds — where they're shifting, what's driving change, and what they're telling us about the health of boreal wetlands.

Mon doctorat a deux volets : certains chapitres portent sur comment surveiller les oiseaux aquatiques boréaux — développer et comparer des méthodes, corriger les biais de détection. D'autres s'interrogent sur ce qui se passe réellement pour ces oiseaux — leurs déplacements, les facteurs de changement, et ce qu'ils nous révèlent sur la santé des milieux humides boréaux.

🔬 How we monitor

🔬 Comment surveiller

🌍 What's happening to the birds

🌍 Ce qui arrive aux oiseaux

Tools & Code

Outils et code

I build open-source tools in R and Python to solve real problems in acoustic and ecological workflows. Reproducible code, transparent methods.

🦅 HawkEars Validator (R Shiny)

A lightweight Shiny app for rapid QA/QC of CNN-based bird acoustic recognizer outputs. Go through clips, view spectrograms, listen to audio, and record structured validations (yes / no / unsure) to a traceable CSV.

View on GitHub

🎛️ Acoustic Localization Pipelines (Python + R)

Multi-species HawkEars/OpenSoundscape acoustic localization scripts (using Frontier Labs Bar-LT with localization firmware), including threshold calibration methodology for boreal species.

📊 WildTrax Data Pipelines (R)

Refactored data pipelines merging ARU and point count project exports from WildTrax, resolving type inconsistencies and building reproducible workflows for CWS-PRA analyses.

All my code on GitHub

Je développe des outils open source en R et Python pour résoudre de vrais problèmes dans les flux de travail acoustiques et écologiques. Code reproductible, méthodes transparentes.

🦅 HawkEars Validator (R Shiny)

Une application Shiny légère pour valider rapidement les sorties d'un recognizer acoustique CNN. Parcourez les extraits, visualisez les spectrogrammes, écoutez l'audio et enregistrez des validations structurées (oui / non / incertain) dans un fichier CSV traçable.

Voir sur GitHub

🎛️ Pipelines de localisation acoustique (Python + R)

Scripts de localisation acoustique multi-espèces HawkEars/OpenSoundscape (utilisant le Frontier Labs Bar-LT avec micrologiciel de localisation), incluant une méthodologie de calibration des seuils pour des espèces boréales.

📊 Pipelines de données WildTrax (R)

Pipelines de données refactorisés pour fusionner les exports de projets ARU et points d'écoute de WildTrax, avec des flux de travail reproductibles pour les analyses du SCF-RPP.

Tout mon code sur GitHub

Publications

Publications

Peer-reviewed articles and popular science writing. Full list on Google Scholar.

Articles scientifiques et articles de vulgarisation. Liste complète sur Google Scholar.

In preparation / In review

En préparation / En révision

About Me

À propos

I'm a wildlife biologist and PhD student in Dr. Erin Bayne's lab at the University of Alberta. My PhD sits at the intersection of methodology and conservation: the question driving everything is whether we can trust our monitoring data to reflect reality — and if not, how do we fix it?

I'm also affiliated with Environment and Climate Change Canada's Canadian Wildlife Service Prairie Region, where I contribute to the Boreal Bird Monitoring Program. I live in the Beaverhill Biosphere Reserve and serve on its board — a region I care deeply about and where conservation and community intersect.

Outside of research, I love running, skiing, and backpacking (type 2 fun), building interactive R apps, and collaborating on open science. You'll often find me outside with binoculars, wondering whether that call was an Ivory-billed Woodpecker or wishful thinking 😉

Je suis biologiste de la faune et doctorante dans le laboratoire du Dr Erin Bayne à l'Université de l'Alberta. Mon doctorat se situe à l'intersection de la méthodologie et de la conservation : la question centrale est de savoir si nous pouvons faire confiance à nos données de suivi pour refléter la réalité — et sinon, comment y remédier.

Je suis également associée au Service canadien de la faune de la région des Prairies d'Environnement et Changement climatique Canada, où je contribue au Programme de surveillance des oiseaux boréaux. Je vis dans la Réserve de biosphère des Beaver Hills et siège à son conseil d'administration — une région qui me tient à cœur, où conservation et communauté se rejoignent.

En dehors de la recherche, j'aime courir, skier et randonner (plaisir de type 2), développer des applications en R, et collaborer sur des projets de science ouverte. Vous me trouverez souvent dehors avec des jumelles, à me demander si cet appel était bien un Pic à bec ivoire ou juste mon imagination 😉

Affiliations

Affiliations

  • Bayne Lab, University of Alberta
  • Weston Family Boreal Research Fellow (2026–2027)
  • Alberta Biodiversity Monitoring Institute (ABMI)
  • Environment & Climate Change Canada, CWS-PRA
  • Boreal Avian Modelling (BAM) Project
  • Beaverhill Biosphere Reserve (Board member) 🌾

Datasets I use

Données que j'utilise

  • Boreal Bird Monitoring Program (BBMP)
  • Waterfowl Breeding Population & Habitat Survey (WBPHS)
  • PRISM shorebird monitoring
  • WildTrax — ARU & point count platform
  • BAM v5 density surfaces

Visual Art

Art visuel

Outside of research I'm a visual artist — follow my work on Instagram @megahfauna. Unsurprisingly, a lot of it involves birds and boreal landscapes.

En dehors de la recherche, je suis artiste visuelle — suivez mon travail sur Instagram @megahfauna. Sans surprise, beaucoup de mes œuvres représentent des oiseaux et des paysages boréaux.

Artwork by Megan Edgar Canada lynx artwork by Megan Edgar Community artwork by Megan Edgar Long-billed curlew artwork by Megan Edgar
📸 @megahfauna on Instagram

Contact

Contact

Interested in collaborating, chatting about boreal birds, detection methods, or open science tools? I'd love to hear from you.

Intéressé(e) par une collaboration, une discussion sur les oiseaux boréaux, les méthodes de détection ou les outils de science ouverte? Je serais ravie d'échanger.

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